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打开发文新视角!深挖癌症的免疫治疗数据!

元宇宙app官方版下载 2022年10月04日 08:11 94 Connor

来源:小张聊科研平台的“ i生信”公众号,微信公众号搜索“ i生信”即可关注/扫描关注见文末

#免疫治疗# #生信分析# #肿瘤#

今年是诺奖颁发给PD-1发现者的第四个年头,免疫治疗的热度持续走高。针对大多数患者接受联合治疗尚不能取得临床获益的现状,进一步开发靶向免疫细胞,特别是控制T细胞功能的额外免疫检查点的药物具备非常重要的意义。

让我们首先来看看各种肿瘤环境的名词解释吧~

1、肿瘤微环境:

实体瘤中由免疫细胞、基质细胞、血管/淋巴管、神经末梢和细胞外基质(ECM)组成的复杂环境。

2、肿瘤免疫微环境(TIME):

由免疫系统的不同细胞组组成的免疫系统及其在TME生态位中的相互作用,已被认为在癌症发生、癌症进展和治疗反应过程中发挥关键作用。TIME可分为浸润性排斥(“冷肿瘤”)和浸润性炎症(“热肿瘤”),“热肿瘤”表面有更多特异的分子标志物,可以被T细胞识别和攻击,从而触发抗肿瘤免疫反应。

3、系统性肿瘤免疫环境(STIE):

主要由免疫调节分子和免疫细胞组成,受到循环的血液和淋巴管控制,在原发肿瘤部位与远处器官和宿主免疫器官(如骨髓和淋巴结)之间的沟通中发挥着至关重要的作用。功能性免疫调节剂包括蛋白质、细胞因子和代谢产物,而免疫细胞包括髓系细胞(中性粒细胞、单核细胞、巨核细胞、血小板、碱性粒细胞、嗜酸性粒细胞)和淋巴系细胞(T细胞、B细胞/浆细胞和NK细胞)。

面对如此复杂的肿瘤环境,免疫检查点抑制剂(ICIs)的免疫疗法还有用武之地吗?这篇发表在Nat Rev Clin Oncol的综述“Enhancing immunotherapy in cancer by targeting emerging immunomodulatory pathways”从1)T细胞的成熟;2)靶向共刺激受体;3)靶向T细胞代谢方面,为我们总结讨论了目前靶向共刺激和共抑制T细胞受体的药物的潜力和临床发展,揭示了进一步优化联合ICI治疗时机的必要性,并需要根据患者特异性和肿瘤特异性特征进行个体化免疫治疗。

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那么以免疫治疗为主要切入点的文章案例又有哪些呢?

案例1:

预测免疫治疗响应的大手笔研究

“Prediction of biomarkers and therapeutic combinations for anti-PD-1 immunotherapy using the global gene network association”

主要看点:关于免疫治疗响应的预测标志物,前人文献中已经报道过很多,如基因组水平的TMB,转录组水平的PD-1的表达等。那这篇同样是做预测标志物的文章,为什么还能发NC呢?从下面这个流程图中可窥一斑,以往的预测标志物(1)没有考虑肿瘤基因/途径与免疫治疗响应之间的关系,(2)忽略了肿瘤间及肿瘤内部的不同,(3)未提供能提升免疫检查点疗法响应率的治疗靶点,未在临床意义上进行拔高。这篇文章探究了可以预测免疫治疗响应的生物标志物,并确定了可以扩大免疫检查点疗法响应率的治疗靶点。

案例2:

结合肿瘤微环境组分——三级淋巴结构的生信好文

“Tertiary lymphoid structures marker CXCL13 is associated with better survival for patients with advanced-stage bladder cancer treated with immunotherapy.”

主要看点:这篇文章可以说是三级淋巴结构(TLS)明星分子(CXCL13)的肿瘤预后研究生信范文!CXCL13是一种B细胞趋化因子,直接参与炎症部位TLS的形成,是TLS的可靠转录标记物,对TLS的形成至关重要。作者基于公共数据库肌肉浸润性膀胱癌(MIBC)转录组数据,评估了CXCL13转录本的表达是否可以作为免疫检查点治疗的MIBC患者预后的生物标志物,并研究它是否可以作为MIBC中TLS的生物标志物。

除此之外,如今癌症免疫治疗研究相关的数据库也是层出不穷,比如超级好用的ICBatlas数据库(治疗患者样本数据,分子机制、靶基因及相关通路、免疫治疗响应标志物、目标免疫细胞群在免疫治疗数据集的表达分布情况等等尽数收录,还愁挖掘不到你想要的信息?

那么,挖掘癌症的免疫治疗都可以申请怎样的课题呢?

数据来源:基金委、

Paper助手()

综上,通过对各类肿瘤环境“开刀”,癌症的免疫治疗还有大把的数据等待挖掘呢!再结合基础研究或者临床验证,课题的含金量上不封顶!

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标签: 深挖 发文 癌症 视角 免疫

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